Impfungen für die Ein- und Ausreise sind zurzeit für Reisende aus den deutschsprachigen Ländern keine vorgeschrieben.
Bei den örtlichen Gesundheitsämtern werden aber unterschiedliche Impfungen empfohlen. Auch eine medikamentöse Malariaprophylaxe wird noch von manchen europäischen Ärzten empfohlen, obwohl der Risiken/Nutzen-Faktor sehr umstritten ist und in Paraguay kaum noch Fälle bekannt sind.
Das Malariarisiko in PY ist gering, Asuncion gilt als malariafrei. In Paraguay kommt ausschließlich die weniger gefährliche Form der Malaria vor (Malaria tertiana durch Plasmodium vivax).
Bei längeren Aufenthalten in ausgewiesenen Endemiegebieten kann man eine Dosis Chloroquin (z.B. Resochin®) zur Notfallselbstbehandlung (sog. Stand-by-Medikation) mitführen.
Dengue-Fieber-Fälle nehmen saisonal im Sommer in verschiedenen Departements des Landes zu. Der beste Schutz (vor der Übertragung von Malaria und Dengue durch Mückenstiche) ist ein Insektenschutzmittel sowie unter einem Moskitonetz oder in Räumen mit Moskitogittern zu schlafen.